晋恒软件的商户管理系统是一个集中式的商户信息管理和结算业务处理系统。在业务上涉及到商户管理和结算领域的各个方面；在技术上涉及到信息技术、通信技术、安全技术的各个领域。本系统既是国内专门从事商户管理和运营的企业（如中国银联商务公司等）的核心业务系统，也完全适用于国内商业银行的银行卡部门，为其实现对特约商户和特惠商户的管理和结算业务
商户管理系统的主要业务功能包括：商户情报管理、商户促销管理、交易清分处理、商户结算处理、商户风险管理、差错交易处理、商户机具管理、报表和凭证、统计分析等。